Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms