Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACL1Q9UJ83 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms