Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-18Q9QC07 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms