Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf109Q9NX04 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf109Q9NX04 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms