Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms