Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REPIN1Q9BWE0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms