Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV5

FSD1, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSD1Q9BTV5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSD1Q9BTV5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms