Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms