Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3Q99687 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms