Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms