Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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