Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms