Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LACTB2Q53H82 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms