Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms