Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms