Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms