Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSPP1Q1MSJ5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms