Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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