Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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