Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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FAT1Q14517 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FAT1Q14517 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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