Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms