Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms