Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STX4Q12846 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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