Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms