Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP27A1Q02318 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms