Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DEFA6Q01524 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms