Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1AP62820 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms