Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAG2P55895 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAG2P55895 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAG2P55895 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms