Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA4P51532 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms