Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETFBP38117 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETFBP38117 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETFBP38117 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETFBP38117 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETFBP38117 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETFBP38117 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ETFBP38117 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms