Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms