Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms