Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THRAP3Q9Y2W1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms