Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBQLN4Q9NRR5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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