Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DCLRE1CQ96SD1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms