Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms