Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA6DQ8NFY4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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