Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIEQ8NEW7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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