Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms