Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD40Q6AI12 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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