Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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COL5A1-AS1Q5SY13 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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