Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC142Q17RM4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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