Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIST3H3Q16695 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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