Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms