Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEBPEQ15744 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms