Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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