Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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