Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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MKRN4PQ13434 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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