Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms