Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2C1P98194 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms